Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CYP4F25P-201ENST00000446871 520 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AL133387.3-201ENST00000450669 522 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC008799.1-201ENST00000495909 457 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 2102 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 GSTZ1-216ENST00000556627 919 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 DNM1P34-202ENST00000567850 315 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 TRIM5-201ENST00000380027 2290 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 HMGB4-203ENST00000519684 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 STX18-AS1-206ENST00000608184 3047 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ARMCX5-206ENST00000604957 4640 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
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