Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SGCBQ16585 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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