Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GABRA4-201ENST00000264318 11973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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