Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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