Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 FBN2-204ENST00000508053 11132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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