Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SREBF2Q12772 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms