Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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