Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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