Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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