Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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