Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.71-201ENST00000612122 282 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC005691.1-201ENST00000624723 401 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AL121594.6-201ENST00000633440 261 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TBC1D8B-201ENST00000276175 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TLK2P2-201ENST00000414066 2240 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TCF4-241ENST00000568740 2628 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AMPH-202ENST00000356264 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SPX-201ENST00000256969 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 FXR1-203ENST00000445140 2651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC098657.2-201ENST00000567886 1976 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 NUTM1-203ENST00000537011 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MORN5-201ENST00000373764 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RPL12P5-201ENST00000475149 392 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ENPP7P10-201ENST00000504828 933 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SNCA-211ENST00000508895 905 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC109635.2-202ENST00000529219 500 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC067796.1-201ENST00000586795 496 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SNCA-212ENST00000611107 297 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 uc_338.3-201ENST00000613268 181 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 KCNQ1OT1_2.1-201ENST00000619507 196 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CU638689.4-203ENST00000625185 785 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 MAGI2-214ENST00000628781 2013 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 AC091173.1-201ENST00000505627 2750 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 DDAH1-202ENST00000426972 4017 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 PTPRM-202ENST00000400053 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 EPN2-204ENST00000395620 3860 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 SIRPD-202ENST00000381623 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 CFAP58-202ENST00000369704 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 PAQR5-205ENST00000561153 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CACNB1Q02641 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZNF410-224ENST00000615736 1551 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC021054.1-201ENST00000537514 2338 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MIR1306-201ENST00000408439 85 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RPS23P8-201ENST00000429775 330 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TMEM127-203ENST00000435268 582 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SDHDP2-201ENST00000436937 465 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC104843.1-201ENST00000451203 319 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC012186.1-201ENST00000566702 398 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC093249.5-201ENST00000568120 430 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms