Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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