Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PRPF4BQ13523 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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