Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms