Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms