Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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HOXD10P28358 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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