Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN7O94888 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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