Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SHOC2Q9UQ13 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms