Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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