Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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GRIK4Q16099 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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GRIK4Q16099 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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GRIK4Q16099 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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GRIK4Q16099 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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GRIK4Q16099 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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GRIK4Q16099 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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GRIK4Q16099 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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GRIK4Q16099 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GRIK4Q16099 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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