Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 ISX-201ENST00000308700 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRHP20396 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 VPS8-204ENST00000424463 2359 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 CDC37L1-AS1-201ENST00000607997 463 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC025031.5-201ENST00000623851 2523 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRHP20396 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 C2orf42-201ENST00000264434 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 U3.38-201ENST00000408534 216 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRHP20396 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms