Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 DENND2C-201ENST00000393274 6163 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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PKHD1P08F94 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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PKHD1P08F94 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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