Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 IL2RB-201ENST00000216223 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 FADS1-211ENST00000536991 2701 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 CARF-201ENST00000320443 5209 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 ZNF259P1-202ENST00000572422 4912 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 PRR27-202ENST00000502294 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TRHP20396 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 GBAP1-202ENST00000459805 2922 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms