Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms