Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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SNX13Q9Y5W8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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SNX13Q9Y5W8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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SNX13Q9Y5W8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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