Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC4Q9Y296 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms