Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHOC2Q9UQ13 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms