Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms