Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms