Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms