Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP21Q9UK80 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP21Q9UK80 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms