Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX41Q9UJV9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms