Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms