Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms