Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTNAP2Q9UHC6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms