Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms