Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms