Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DKK4Q9UBT3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms