Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPASTQ9UBP0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPASTQ9UBP0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms