Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARHGAP28Q9P2N2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARHGAP28Q9P2N2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP28Q9P2N2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP28Q9P2N2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP28Q9P2N2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP28Q9P2N2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms