Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP35Q9P2H5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
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