Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms