Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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