Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TOR4AQ9NXH8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms