Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT57Q9NWB7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms