Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM28Q9NW13 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM28Q9NW13 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms