Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms