Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PARVAQ9NVD7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms