Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC4Q9NTJ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms