Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG3Q9NT62 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms